Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM55Q9BYV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM55Q9BYV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM55Q9BYV6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM55Q9BYV6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms