Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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KRTAP9-3Q9BYQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP9-3Q9BYQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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