Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RNF17Q9BXT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
RNF17Q9BXT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RNF17Q9BXT8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RNF17Q9BXT8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RNF17Q9BXT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RNF17Q9BXT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RNF17Q9BXT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RNF17Q9BXT8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RNF17Q9BXT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RNF17Q9BXT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RNF17Q9BXT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RNF17Q9BXT8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RNF17Q9BXT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RNF17Q9BXT8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RNF17Q9BXT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms