Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFXN3Q9BWM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFXN3Q9BWM7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN3Q9BWM7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN3Q9BWM7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN3Q9BWM7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN3Q9BWM7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN3Q9BWM7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN3Q9BWM7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms