Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC2P3Q9BVR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC2P3Q9BVR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERC2P3Q9BVR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC2P3Q9BVR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC2P3Q9BVR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms