Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP58Q9BVL2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP58Q9BVL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP58Q9BVL2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP58Q9BVL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms