Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPON2Q9BUD6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPON2Q9BUD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPON2Q9BUD6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPON2Q9BUD6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPON2Q9BUD6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms