Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRDL1Q9BU40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRDL1Q9BU40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRDL1Q9BU40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRDL1Q9BU40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRDL1Q9BU40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms