Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED2Q9BTP6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED2Q9BTP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZBED2Q9BTP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED2Q9BTP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED2Q9BTP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED2Q9BTP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED2Q9BTP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms