Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFJQ9BTM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFJQ9BTM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2AFJQ9BTM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFJQ9BTM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFJQ9BTM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms