Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NICN1Q9BSH3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NICN1Q9BSH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NICN1Q9BSH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms