Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22CQ9BRL7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22CQ9BRL7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22CQ9BRL7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22CQ9BRL7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms