Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VGLL1Q99990 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VGLL1Q99990 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VGLL1Q99990 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VGLL1Q99990 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms