Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CITED2Q99967 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED2Q99967 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED2Q99967 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED2Q99967 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms