Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS1Q99742 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS1Q99742 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPAS1Q99742 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS1Q99742 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS1Q99742 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS1Q99742 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS1Q99742 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS1Q99742 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS1Q99742 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms