Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPER1Q99527 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPER1Q99527 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPER1Q99527 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPER1Q99527 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPER1Q99527 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms