Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NAP1L3Q99457 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NAP1L3Q99457 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NAP1L3Q99457 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NAP1L3Q99457 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NAP1L3Q99457 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms