Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP9

GFM1, Elongation factor G, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFM1Q96RP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFM1Q96RP9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFM1Q96RP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFM1Q96RP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFM1Q96RP9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GFM1Q96RP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GFM1Q96RP9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFM1Q96RP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFM1Q96RP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFM1Q96RP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFM1Q96RP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms