Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1H4Q96RI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H4Q96RI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H4Q96RI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1H4Q96RI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms