Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IPQ96QF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB3IPQ96QF0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IPQ96QF0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IPQ96QF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms