Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC85AQ96PX6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC85AQ96PX6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC85AQ96PX6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC85AQ96PX6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC85AQ96PX6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC85AQ96PX6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms