Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF396Q96N95 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF396Q96N95 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF396Q96N95 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF396Q96N95 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF396Q96N95 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF396Q96N95 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms