Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00167Q96N53 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00167Q96N53 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00167Q96N53 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms