Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
YTHDC1Q96MU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
YTHDC1Q96MU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
YTHDC1Q96MU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
YTHDC1Q96MU7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
YTHDC1Q96MU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
YTHDC1Q96MU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms