Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf90Q96M02 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf90Q96M02 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C10orf90Q96M02 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C10orf90Q96M02 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C10orf90Q96M02 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms