Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALR3Q96L12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALR3Q96L12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALR3Q96L12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALR3Q96L12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms