Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
THOC3Q96J01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THOC3Q96J01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THOC3Q96J01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THOC3Q96J01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THOC3Q96J01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THOC3Q96J01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms