Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SFRP2Q96HF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SFRP2Q96HF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SFRP2Q96HF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms