Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC46Q96FV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC46Q96FV0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC46Q96FV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC46Q96FV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms