Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23CQ96ET8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23CQ96ET8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23CQ96ET8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23CQ96ET8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms