Protein–RNA interactions for Protein: Q96DG6

CMBL, Carboxymethylenebutenolidase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMBLQ96DG6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMBLQ96DG6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMBLQ96DG6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CMBLQ96DG6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMBLQ96DG6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMBLQ96DG6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms