Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RMDN1Q96DB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RMDN1Q96DB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN1Q96DB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RMDN1Q96DB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RMDN1Q96DB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms