Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf43Q96C57 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C12orf43Q96C57 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C12orf43Q96C57 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf43Q96C57 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms