Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD2Q96BF3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMIGD2Q96BF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms