Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM63Q969Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM63Q969Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM63Q969Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM63Q969Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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