Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF34Q969K3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF34Q969K3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF34Q969K3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF34Q969K3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms