Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCE1Q969G3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SMARCE1Q969G3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCE1Q969G3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMARCE1Q969G3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCE1Q969G3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms