Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSMEM1Q8WWF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSMEM1Q8WWF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSMEM1Q8WWF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSMEM1Q8WWF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms