Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMBR1Q8WVP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBR1Q8WVP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMBR1Q8WVP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMBR1Q8WVP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms