Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2AF1L4Q8WU68 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
U2AF1L4Q8WU68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
U2AF1L4Q8WU68 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
U2AF1L4Q8WU68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L4Q8WU68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L4Q8WU68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
U2AF1L4Q8WU68 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
U2AF1L4Q8WU68 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2AF1L4Q8WU68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2AF1L4Q8WU68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms