Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSC4DQ8WTU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSC4DQ8WTU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSC4DQ8WTU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC4DQ8WTU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC4DQ8WTU2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
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