Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAP25Q8TEE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAP25Q8TEE9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SAP25Q8TEE9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAP25Q8TEE9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAP25Q8TEE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAP25Q8TEE9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAP25Q8TEE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAP25Q8TEE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAP25Q8TEE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAP25Q8TEE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAP25Q8TEE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268 ms