Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NUP35Q8NFH5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP35Q8NFH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP35Q8NFH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP35Q8NFH5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP35Q8NFH5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms