Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF548Q8NEK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF548Q8NEK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF548Q8NEK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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