Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC191Q8NCU4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC191Q8NCU4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC191Q8NCU4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC191Q8NCU4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC191Q8NCU4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC191Q8NCU4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC191Q8NCU4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC191Q8NCU4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms