Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC1AQ8NC01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC1AQ8NC01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC1AQ8NC01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC1AQ8NC01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms