Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8N9G6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8N9G6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8N9G6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8N9G6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8N9G6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8N9G6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8N9G6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8N9G6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8N9G6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8N9G6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8N9G6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8N9G6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8N9G6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8N9G6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8N9G6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8N9G6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8N9G6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8N9G6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8N9G6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8N9G6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8N9G6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8N9G6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8N9G6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8N9G6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8N9G6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8N9G6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8N9G6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8N9G6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8N9G6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8N9G6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8N9G6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8N9G6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8N9G6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8N9G6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8N9G6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8N9G6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8N9G6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8N9G6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8N9G6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8N9G6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8N9G6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8N9G6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8N9G6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8N9G6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8N9G6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8N9G6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8N9G6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8N9G6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8N9G6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8N9G6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8N9G6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8N9G6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8N9G6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8N9G6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8N9G6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8N9G6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8N9G6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8N9G6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8N9G6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8N9G6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8N9G6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8N9G6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8N9G6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8N9G6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8N9G6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8N9G6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.2 ms