Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMD12Q8N8I0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD12Q8N8I0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 780.8 ms