Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTD1Q8N815 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTD1Q8N815 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTD1Q8N815 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTD1Q8N815 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTD1Q8N815 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNTD1Q8N815 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms