Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR7Q8N806 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR7Q8N806 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR7Q8N806 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR7Q8N806 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR7Q8N806 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBR7Q8N806 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBR7Q8N806 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBR7Q8N806 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR7Q8N806 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBR7Q8N806 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR7Q8N806 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR7Q8N806 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR7Q8N806 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBR7Q8N806 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBR7Q8N806 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBR7Q8N806 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR7Q8N806 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR7Q8N806 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBR7Q8N806 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UBR7Q8N806 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBR7Q8N806 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBR7Q8N806 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR7Q8N806 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBR7Q8N806 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR7Q8N806 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms